当一位科学家穿越到忍界！“查克拉与自然能量有什么关系？”“鬼灯一族为什么可以水化？”“大筒木一族的身体构造又是什么样的？”带着这些疑问，宇智波启离开了木叶。他用自己这双可以看穿万物的写轮眼，探究忍界隐秘。当某一天，大筒木一族降临，想将忍界化为神树的养料时，启反手掏出了，自己种出的神树果实。
